（一）外部流程時限
　　1．報檢時限
　　入境貨物應在貨物入境前或入境時由貨主或代理人接運單位憑有關(guān)單證向到貨口岸、指定的或到達站的檢驗檢疫機構(gòu)輸報檢手續(xù)；入境的運輸工具或人員應由船方代理、鐵路局（站）、航空公司等在入境前或入境時報檢。
　　入境貨物以及需對外出證的貨物收用貨部門或代理部門于貨物報檢后通關(guān)后應索賠有效期前不少于20天內(nèi)向口岸或貨物目的地的檢驗檢疫機構(gòu)報檢，申請檢驗檢疫。
　　輸入種畜、禽及其精液、胚胎的，應當在進境前30天報檢。
　　輸入其他動物的，應當在進境前15天報檢。
　　輸入植物、種子、種苗及其他繁殖材料的，應當在入境前7天報檢。
　　出境貨物最遲應于報關(guān)或裝運前十天報檢，對于個別檢測周期較長的貨物，應留有相應的實驗室工作時間。報檢30天后仍未辦理檢驗檢疫事宜的，做自動撤消報檢處理。
　　出境的運輸工具和人員應在出境前報檢。
　　出境動物在出境前60天預報，隔離前7天報檢。
　　2．交費的時限
　　出入境檢驗檢疫機構(gòu)依法對出入境人員及應檢物實施檢驗檢疫、監(jiān)督查驗、檢疫處理等，按規(guī)定計收的檢驗檢疫費，報檢人應在報檢時交納。
　　3．通關(guān)的時限
　　出入境檢驗檢疫機構(gòu)簽發(fā)《通關(guān)單》后出境貨物的通關(guān)出運時限一般貨物為60天；植物和植物產(chǎn)品為21天；鮮活類貨物為14天或特殊規(guī)定的時限。入境貨物的通關(guān)時限不超過7天；通關(guān)后一周內(nèi)，應到有關(guān)檢驗檢疫機構(gòu)聯(lián)系檢驗檢疫事宜。逾期的應重新辦理報檢手續(xù)。
　　（二）內(nèi)部流程時限
　　內(nèi)部流程時限是指出入境檢驗檢疫機構(gòu)從辦理報檢到簽證、放行等工作環(huán)節(jié)之間的時限。內(nèi)部流程時限主要有以下幾種：
　　1．施檢周期是指施檢部門從抽樣起計算，到檢驗檢疫或檢驗檢疫處理事項完成并出具檢驗檢疫報告（擬稿）止。該周期是檢驗檢疫流程時限的核心。檢驗檢疫周期因檢驗檢疫對象和輸出/輸入國家或地區(qū)的差異而不同。
　　2．簽證周期是指施檢部門從檢驗檢疫報告（擬稿）完成后，經(jīng)檢務部門的審稿、制證、復核到簽署檢驗檢疫證單的時間。
　　3．發(fā)證與領(lǐng)證周期主要是指報檢領(lǐng)證的時間。檢務部門簽證與計收費完畢后，其內(nèi)部流程已基本完成，有待報檢人領(lǐng)取證單。報檢人何時領(lǐng)證，由報檢人自由處理。這是一個內(nèi)部流程與外部流程相互結(jié)合的特定流程。
　　4．檢驗檢疫機構(gòu)內(nèi)部業(yè)務周轉(zhuǎn)周期是指檢驗檢疫機構(gòu)對內(nèi)部各部門和崗位之間一個流程的最先環(huán)節(jié)與下一個流程環(huán)節(jié)開始之間證單和業(yè)務周轉(zhuǎn)的時間要求。該周期要求上下工序迅速銜接、速遞，是檢驗檢疫整體工作的體現(xiàn)。