（一）效率高。
1、傳統(tǒng)紙本手冊，受制于8小時工作制；聯網監(jiān)管后，錄入、發(fā)送、網絡傳輸都是24小時的工作制。
2、傳統(tǒng)紙本手冊是對每個合同進行審批，包括準備合同資料、打印、兩次錄入、網絡傳輸、審批等過程，共約需7－8天，甚至10多天。聯網監(jiān)管省卻了前期大量的準備合同資料、錄入時間、電子資料的發(fā)送接收時間，到外經貿部門申請聯網監(jiān)管批準證和到海關進行電子賬冊備案都是通過計算機網絡進行，審批大約需要兩天時間。
3、按傳統(tǒng)合同手冊，一般情況下每個企業(yè)都有幾十本，甚至上百本手冊，報關單的數量也相當驚人，導致的手冊之間的結轉、核銷的工作量非常大；按聯網監(jiān)管，企業(yè)只需一個業(yè)務批準證，一本電子賬冊，實行滾動核銷，報關單的數量將會明顯下降，核銷期間照常通關，企業(yè)進出口通關效率會得到大幅提高。
4、企業(yè)申請批準證，除第一次申請需要提交法律規(guī)定的材料以外，以后申請批準證、變更、核銷等直接從網上進行申請，外經貿部門審批后，企業(yè)不需要帶任何資料，直接到審批部門領取批準證，很大程度上方便了企業(yè)。
（二）靈活性強。
1、單耗分段備案，最遲可在成品出口前備案，根據成品版本號申報準確實際的單損耗情況，申報數據更加準確。
2、通關時無須調度手冊，只用一本電子賬冊，不會串料，自動核對核算，提高核銷的效率及精度，通過最大批準量、最大周轉金額進行控制，中期核查使企業(yè)既能及時糾正或預先堵塞企業(yè)內部物流管理漏洞。
3、進口料件和出口成品的海關編碼都實行4位管理，實行大類歸并，商品小類變更由企業(yè)自行做主，不必報審批機關批準，使企業(yè)在同一時間內可以接收更多的訂單，提高企業(yè)接單的靈活性和自主性。
（三）費用省。
1、企業(yè)生產成本下降。聯網監(jiān)管實行分段備案、只控制料件的最大周轉量和周轉金額，不受具體合同料件數量和金額的限制，更適應企業(yè)現代生產經營和物流要求，使企業(yè)得以按生產管理的實際需要安排物流和組織進出口，大大減少企業(yè)庫存，生產成本大幅度降低。據聯網監(jiān)管企業(yè)奧林巴斯反映，聯網監(jiān)管后，企業(yè)每個月僅在庫金額一項就下降了340萬港幣。
2、企業(yè)交納的費用減少。按傳統(tǒng)合同手冊，加工貿易企業(yè)要按料件清單份數交納錄入費；聯網監(jiān)管后，企業(yè)只需交納網絡維護費，能節(jié)省大量經營費用。